Poštovane koleginice i kolege,
Naredni sastanak seminara Bioinformatika biće održan online ove srede, 24.2. u 18:15. Izlagaće Anđela Rodić, asistent Biološkog fakulteta na Katedri za opštu fiziologiju i biofiziku. Kao član grupe prof. Marka Đorđevića, Anđela se bavi istraživanjima u oblasti sistemske biologije, odnosno biofizičkog modelovanja bioloških sistema. Naslov predavanja je "Biofizički i bioinformatički pristup u istraživanju prenošenja virusa SARS-CoV-2 u populaciji", a apstrakt predavanja možete pronaći u nastavku.
Link za predavanje:
https://matf.webex.com/matf/j.php?MTID=m800dee92df07e3de2c33a02ce77ce5b4Meeting number (access code): 183 485 1215
Meeting password: 3ZHyPQJG2C6
Link će biti aktivan od 18h.
Organizator seminara Bioinformatika je Srpsko društvo za bioinformatiku i računarsku biologiju (
http://www.birbi.matf.bg.ac.rs/).
Srdačan pozdrav,
rukovodioci Seminara
Gordana Pavlović-Lažetić
Nenad Mitić
Anđela Rodić
-----------------------------------------------------
Apstrakt
Biofizičari sa Biološkog fakulteta su, u saradnji sa naučnicima i nastavnicima sa Instituta za fiziku i Medicinskog fakulteta, sproveli istraživanje uticaja demografskih i klimatskih faktora na prenošenje virusa-izazivača bolesti COVID-19. Istraživanje kombinuje biofiziku (primena nelinearnih dinamičkih kompartmentalnih modela), bioinformatiku (prikupljanje i analiza velike količine podataka) i analizu široko rasprostranjenih obrazaca rasta infekcije ("scaling relations" u biofizici). Dobijeni rezultati ukazuju na to da nekoliko demografskih i meteoroloških faktora značajno utiče na inherentnu prenosivost (osnovni reprodukcioni broj) virusa u populaciji. Takođe je analizirana i disproporcija između intenzivnog širenja infekcije u Vuhanu (Hubei) i mnogo manjih brojeva zaraženih u drugim kineskim provincijama. Predloženo je da se ova zagonetka može objasniti kombinacijom značajno veće inherentne prenosivosti virusa u Vuhanu (R0 koje zavisi upravo od faktora sredine) i veće efikasnosti mera za suzbijanje epidemije u drugim provincijama. Ukupno gledano, rezultati ovih analiza ukazuju na to da dinamika širenja epidemije može značajno da zavisi od potencijalno visoko heterogenih i naizgled slučajnih faktora, kao što su varijacije u demografskim i meteorološkim uslovima, kao i od njihove složene interakcije sa uvedenim merama kontrole. Razumevanje ovih faktora je ključno, ne samo za analizu rizika tokom pandemije, već i za dugoročno predviđanje ponašanja virusa u populaciji u slučaju da bolest postane endemična.