[phys4phys] BioPhysLab seminar: Vladana Vukojević, Ponedeljak, 25. decembar 2023, 11:00

Wed Dec 20 14:20:27 CET 2023

Poštovane koleginice i kolege,  

Zadovoljstvo mi je da vas pozovem na seminar Laboratorije za Biofiziku,
koji će biti održan u ponedeljak 25.12.2023. godine u 11:00h u čitaonici
"Dr Dragan Popović" u Institutu za fiziku u Beogradu. Seminar pod
naslovom  

"Fluorescentna korelaciona spektroskopija - teorijske osnove i primena u
biomedicinskim istrazivanjima" 

će održati prof. dr Vladana Vukojević, vanredni profesor biohemije,
Karolinska institut, Stokholm, Švedska.  

Apstrakt 

Fluorescentna korelaciona spektroskopija (FCS od engleskog Fluorescence
Correlation Spectroscopy) je metoda kvalitativne analize nastala 70-tih
godina 20. veka, koja je prevashodno razvijana kako bi se omogućila
nedestruktivna karakterizacija kinetike brzih hemijskih procesa u
rastvoru [1,2]. Za razliku od relaksacionih metoda, kao što je na primer
T-jump, koje analiziraju povratak sistema u ravnotežno/neravnotezno
stacionarno stanje nakon namerno izazvanih velikih poremećaja
(perturbacija), FCS se oslanja na analizu spontanih fluktuacija oko
stacionarnog stanja kako bi se dobile informacije o koncentraciji,
difuziji i interakcijama fluorescentnih/fluorescentno obeleženih
molekula u rastvoru. Kasniji razvoj FCS instrumentacije omogućio je
merenje koncentracije, difuzije i interakcija između
fluorescentnih/fluorescentno obeleženih molekula u živim ćelijama [3-5].
U svom izlaganju ukratko ću se osvrnuti na teorijske osnove FCS metode i
pokazaću, koristeći primere iz vlastitog istraživanja, primenu FCS
metode u biološkim istraživanjima [5] i medicinskoj dijagnostici [6]. Na
kraju, pokazaću kako mi, u saradnji sa kolegama sa Instituta za fiziku,
Univerziteta u Beogradu, doprinosimo daljem razvoju FCS metode [7-9].   

[1] Magde D, Elson E, Webb WW. Thermodynamic Fluctuations in a Reacting
System--Measurement by Fluorescence Correlation Spectroscopy. Phys. Rev.
Lett. 1972 29(11):705-708. 

[2] Ehrenberg M, Rigler R. Rotational brownian motion and fluorescence
intensify fluctuations. Chem. Phys. 1974 4(3):390-401. 

[3] Berland KM, So PT, Gratton E. Two-photon fluorescence correlation
spectroscopy: method and application to the intracellular environment.
Biophys J. 1995 68(2):694-701. 

[4] Schwille P, Korlach J, Webb WW. Fluorescence correlation
spectroscopy with single-molecule sensitivity on cell and model
membranes. Cytometry. 1999 36(3):176-182. 

[5] Vukojevic V, Papadopoulos DK, Terenius L, Gehring WJ, Rigler R.
Quantitative study of synthetic Hox transcription factor-DNA
interactions in live cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010
107(9):4093-4098. 

[6] Tiiman A, Jelić V, Jarvet J, Järemo P, Bogdanović N, Rigler R,
Terenius L, Gräslund A, Vukojević V. Amyloidogenic Nanoplaques in Blood
Serum of Patients with Alzheimer's Disease Revealed by Time-Resolved
Thioflavin T Fluorescence Intensity Fluctuation Analysis. J Alzheimers
Dis. 2019 68(2):571-582. 

[7] Krmpot AJ, Nikolić SN, Oasa S, Papadopoulos DK, Vitali M, Oura M,
Mikuni S, Thyberg P, Tisa S, Kinjo M, Nilsson L, Terenius L, Rigler R,
Vukojević V. Functional Fluorescence Microscopy Imaging: Quantitative
Scanning-Free Confocal Fluorescence Microscopy for the Characterization
of Fast Dynamic Processes in Live Cells. Anal Chem. 2019
91(17):11129-11137. 

[8] Oasa S, Krmpot AJ, Nikolić SN, Clayton AHA, Tsigelny IF, Changeux
JP, Terenius L, Rigler R, Vukojević V. Dynamic Cellular Cartography:
Mapping the Local Determinants of Oligodendrocyte Transcription Factor 2
(OLIG2) Function in Live Cells Using Massively Parallel Fluorescence
Correlation Spectroscopy Integrated with Fluorescence Lifetime Imaging
Microscopy (mpFCS/FLIM). Anal Chem. 2021 93(35):12011-12021. 

[9] Nikolić SN, Oasa S, Krmpot AJ, Terenius L, Belić MR, Rigler R,
Vukojević V. Mapping the Direction of Nucleocytoplasmic Transport of
Glucocorticoid Receptor (GR) in Live Cells Using Two-Foci
Cross-Correlation in Massively Parallel Fluorescence Correlation
Spectroscopy (mpFCS). Anal Chem. 2023 95(41):15171-15179. 

Biografija 

Dr Vladana Vukojević, je studije fizičke hemije završila na Fakultetu
za fizičku hemiju Univerziteta u Beogradu 1989. godine i iste godine
upisala poslediplomske studije fizičke hemije. U okviru poslediplomskih
studija boravila je na stručnom usavršavanju na Odseku za fizičku hemiju
(Kem. Lab III), H. K. Ersted Instituta (H. C. Ørsted Institutet),
Univerzitet u Kopenhagenu, Danska, gde je uradila deo ekspermentalnih
ispitivanja za magistarski rad (1990-1991). Magistarski rad je odbranila
1993. godine, a doktorsku tezu 2000. godine na Fakultetu za fizičku
hemiju Univerziteta u Beogradu. Na Fakultetu za fizičku hemiju radila je
od 1992. do 2005. godine, pri čemu je u toku 1992-1999 radila i na
Faramceutskom fakultetu (do 30 % radnog vremena). Od 2005. godine radi
na medicinskom univerzitetu Karolinska institut, Odsek za kliničke
neuronauke, Štokholm, Švedska, gde je 2011. godine izabrana u zvanje
vanrednog profesora biohemije. 

Na doktorskim studijama na Karolinska institutu, dr Vladana Vukojević
vodi nastavu iz predmeta "Funkcionalna fluorescentna mikroskopija u
biomedicinskim istraživanjima" kojeg je uvela 2010. godine. Gostujući
je predavač i ko-osnivač letnje radionice iz Fluorescentne mikroskopije
i korelacione spektroskopije Hokkaido Summer Institute (HSI), Hokkaido
University, Sapporo, Japan i veoma aktivna u radu ERASMUS+ programa
Evropske zajednice, u okviru koga je osnovala saradnju između Karolinska
instituta i Univerziteta u Beogradu. Dr Vladana Vukojević se veoma
zalaže da nastava na doktorskim studijama bude na visokom nivou. U tom
cilju uvodi savremene metode u proces nastave i, korsteći svoje bogato
iskustvo u pedagoškom, laboratorijskom i teorijskom radu, značajno
pomaže studentima u izradi diplomskih, master i doktorskih radova.

Dr Vladana Vukojević (ORCID: 0000-0003-0873-5653) je svoj istraživački
rad, inicijalno posvećen ispitivanju dinamike i mehanizama nelinearnih
hemijskih sistema, usmerila ka istraživanju složenih biohemijskih
procesa u biološkim sistemima. U svom naučnoistračivačkom radu objavila
je 100 originalnih naučnih radova, od čega je većina štampana u
međunarodnim časopisima izuzetnih vrednosti i u vrhunskim međunarodnim
časopisima. Objavila je 5 preglednih radova, od čega su 3 u vrhunskim
međunarodnim časopisima. Rezultati istraživanja izloženi su na više od
70 skupova međunarodnog značaja, od čega 20 puta kao predavač po pozivu
ili plenarni predavač. Radovi dr Vladane Vukojević su prema bazi Web of
Science citirani  > 1.682 puta (bez samocitata) i vrednost h-indeksa je
26. Prema bazi GoogleScholar, ukupan broj citata bez samocitata je >
2573 (>1110 u poslednjih 5 godina), vrednost h-indeksa je 30 (20 u
poslednjih 5 godina), a vrednost i10-indeksa je 66 (39 u poslednjih 5
godina). Kompletna lista publikacija dr Vladane Vukojević nalazi se na:
https://vvv.ncbi.nlm.nih.gov/mincbi/1FI3gfCGI-Cku/bibliographi/public/
[3]. 

Dr Vladana Vukojević je recenzent velikog broj naučnih časopisa, kao
što su: Cell, Analytical Chemistry, Scientific Reports, Frontiers in
Molecular Neuroscience, Journal of Physical Chemistry, Biophysical
Journal, PLoS Computational Biology, Translational Psychiatry, Langmuir,
FEBS Letters, Current Medicinal Chemistry, Computers in Biology and
Medicine, Cell Biochemistry and Biophysics, Optics Express, Journal of
Structural Biology, Journal of Developmental Biology i drugi. Član je
uredničkog odbora časopisa: Scientific Reports (Editorial Board Member)
i Frontiers in Molecular Neuroscience (Associate Editor). Recenizirala
je predloge projekata za međunarodne agencije kao što su: Human Frontier
Science Program (HFSP), European Research Council (ERC), The Swedish
Research Council (Vetenskapsrådet (VR)), National Scientific
Associations (Netherlands Organization for Scientific Research (NOW),
Medical Research Council (United Kingdom), The Royal Society of
Edinburgh (United Kingdom), Einstein Foundation Berlin (Germany). Dr
Vladana Vukojević učestvuje od 2000. godine u organizacionim
aktivnostima međunarodne konferencije Physical Chemistry, koja se
održava u Beogradu. 

---

dr Aleksandar J. Krmpot, naucni savetnik
BioPhysLab
Institut za fiziku, Pregrevica 118, 11080 Beograd-Zemun, SRBIJA

dr. Aleksandar J. Krmpot, research professor
BioPhysLab
Institute of Physics, Pregrevica 118, 11080 Belgrade- Zemun, SERBIA

telefon/phone:  +381 11 3713 171
mobilni/cell:   +381 64 202 65 62
e-posta/e-mail: krmpot at ipb.ac.rs
www.hemmaginero.rs [1]  
www.ipb.ac.rs [2] 
http://www.ipb.ac.rs/en/istrazivanja/laboratorije-2/laboratorija-za-biofiziku/

Links:
------
[1] http://www.hemmaginero.rs/
[2] http://www.ipb.ac.rs/
[3]
https://vvv.ncbi.nlm.nih.gov/mincbi/1FI3gfCGI-Cku/bibliographi/public/
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://mail.ipb.ac.rs/pipermail/phys4phys/attachments/20231220/32a943c9/attachment.htm>